Terjadinya potensi malpraktik di dalam proses Pengadaan Pembaharuan Lisensi SAP & Pemeliharaan SAP PT MRTJ yang menurut kami rawan adanya keberpihakan dari tim Pengadaan kepada salah satu peserta. 

Secara detail, yang kami maksud adalah sebagai berikut: 
Metode pengadaan yang digunakan adalah submission satu sampul dengan urutan:
a. Pembukaan sampul dan harga penawaran masing-masing peserta diumumkan kepada seluruh peserta.
b. Panitia pengadaan melakukan penilaian teknis *secara tertutup*.
c. Panitia pengadaan mengadakan negosiasi harga kepada peserta dengan nilai teknis tertinggi (tanpa diketahui oleh peserta yang lain). 
d. Panitia pengadaan mengumumkan calon pemenang berdasarkan harga (hasil negosiasi dari poin c) dan nilai teknis (hasil dari poin b) yang terbaik.

Dengan urutan proses pengadaan seperti di atas, akan sangat memungkinkan terjadinya potensi malpraktik dari tim Pengadaan untuk "mengatur" nilai teknis Peserta yang akan dimenangkan. 

Selain itu, kami memandang perlu adanya sesi klarifikasi dan negosiasi terhadap peserta-peserta yang sudah melebihi ambang batas kelulusan teknis yang mana hal ini tidak terjadi dalam proses pengadaan ini.